Медицинские услуги НДС: освобождение, ставки и учёт в 2026

Медицинские услуги НДС — это порядок обложения налогом на добавленную стоимость медицинских услуг, который закреплён в подпункте 1 пункта 2 статьи 149 НК РФ: по общему правилу медицинские услуги освобождены от НДС, если они входят в утверждённый Правительством перечень, оказываются по лицензии и (или) в рамках ОМС. Однако часть услуг всё же облагается по общей ставке — 22% с 1 января 2026 года (Федеральный закон № 425-ФЗ). Ключевые факты, которые нужно знать главному бухгалтеру медицинской организации: освобождение не абсолютно — косметология, телемедицина без лицензии, лабораторные исследования для сторонних организаций могут облагаться; медицинские товары (лекарства, изделия) по общему правилу облагаются НДС, но многие входят в перечень с пониженной ставкой 10%. Разобраться помогает раздельный учёт и корректная настройка 1С.

Эта статья — для главных бухгалтеров частных клиник, стоматологий, медицинских центров и предпринимателей, которые реализуют или приобретают медуслуги и товары. Мы не просто повторяем нормы кодекса, а даём прикладной алгоритм: как отличить облагаемую услугу от необлагаемой, что учесть при работе с товарами, и почему без раздельного учёта не обойтись. Материал опирается на законодательство, действующее в 2026 году.

Наша компания «Интеграция» более семи лет сопровождает бухгалтерский учёт медицинских организаций и настраивает 1С под постоянные изменения налогового регулирования. Практические советы в статье основаны на этом опыте.

Законодательная база: ст. 149 НК РФ и подзаконные акты

Освобождение медицинских услуг от НДС опирается на подпункт 1 пункта 2 статьи 149 НК РФ. Формулировка отсылает к перечню, утверждаемому Правительством РФ. Сегодня действует перечень, введённый постановлением от 29.10.2021 № 1764. Он охватывает диагностику, лечение, хирургию, реабилитацию, стоматологию, профосмотры и другие направления. Условия освобождения: наличие лицензии на медицинскую деятельность; услуга прямо названа в перечне (важны код ОКВЭД и конкретный вид); оказана в рамках ОМС или непосредственно пациенту на возмездной основе лицензиатом. Если хотя бы одно не выполнено, операция считается облагаемой.

С 2026 года общая ставка НДС повышена до 22%. Это закреплено в Федеральном законе № 425-ФЗ от 28.11.2025 (п. 3 ст. 164 НК РФ). При этом сама норма об освобождении осталась без изменений — организации, соответствующие критериям, по-прежнему не выставляют счёт-фактуру с НДС. Важно помнить: право на освобождение не нужно заявлять отдельно — оно действует в силу закона, но подтверждается документами (лицензия, акты оказания услуг, справки об ОМС).

Какие медицинские услуги освобождены от НДС: перечень и условия

Чтобы определить, облагается ли услуга НДС, бухгалтер проверяет три признака: входит ли она в перечень № 1764, есть ли у организации действующая медицинская лицензия, и оказана ли услуга в целях диагностики, лечения или реабилитации пациента. При совпадении всех условий счёт-фактура выставляется с пометкой «Без НДС» либо не выставляется вовсе, если покупатель — физическое лицо.

Перечень № 1764 содержит сотни позиций. Основные группы:

• диагностические услуги (лабораторные, инструментальные, УЗИ, МРТ, КТ, функциональная диагностика);
• лечебные услуги (терапия, хирургия, кардиология, неврология и другие специальности);
• стоматологические услуги (терапевтические, хирургические, ортодонтические, имплантация, протезирование);
• услуги по проведению медицинских осмотров (предварительные, периодические, предрейсовые);
• услуги скорой медицинской помощи;
• санаторно-курортные услуги при наличии медицинской лицензии и назначении лечащего врача.

Услуги, оказанные в рамках территориальной программы ОМС, освобождаются автоматически — даже если конкретная позиция не поименована в перечне № 1764. Это прямо вытекает из подпункта 1 пункта 2 статьи 149 НК РФ.

Когда клиника оказывает и освобождённые, и облагаемые услуги, она обязана вести раздельный учёт доходов, расходов и входного НДС. Без него нельзя корректно принять к вычету налог по затратам, относящимся к облагаемым операциям. Подробнее об этом — в разделе о раздельном учёте.

Какие медицинские услуги облагаются НДС и почему

Медицинские услуги облагаются НДС по ставке 22%, если они не подпадают под освобождение по статье 149 НК РФ. Чаще всего это происходит, когда:

• услуга отсутствует в перечне № 1764;
• у исполнителя нет медицинской лицензии;
• услуга носит немедицинский характер (например, косметологическая процедура без назначения врача).

Типичные облагаемые услуги:

Отдельного внимания заслуживает телемедицина. Если услуга оказывается лицензированной организацией и присутствует в перечне, освобождение применяется. Если же консультация проводится без лицензии или исполнитель находится за пределами РФ — НДС начисляется.

Ошибки в квалификации услуг — частая причина доначислений. Рекомендуем регулярно сверять перечень оказываемых услуг с текстом постановления № 1764 и иметь заключение врача для спорных косметологических процедур.

НДС на медицинские товары: лекарства, изделия, оборудование

В отличие от услуг, реализация медицинских товаров облагается НДС по общему правилу. Однако для социально значимых товаров сохранена пониженная ставка 10%. Она применяется, если одновременно выполняются два условия: товар включён в перечень, утверждённый Правительством РФ (сегодня действует перечень из постановления № 688, актуализированный постановлением № 1042); на товар имеется регистрационное удостоверение — для лекарств запись в Государственном реестре лекарственных средств, для медицинских изделий — регистрационное удостоверение Росздравнадзора.

Полный перечень медицинских товаров, облагаемых по ставке 10%, регулярно обновляется. В него входят:

• жизненно необходимые и важнейшие лекарственные препараты;
• медицинские изделия (например, шовный материал, перевязочные средства, ортопедическая обувь, трости, костыли, инвалидные коляски);
• имплантаты и эндопротезы;
• очковые линзы и оправы (кроме солнцезащитных).

Важно: если товар отсутствует в перечне, даже наличие регистрационного удостоверения не даёт права на ставку 10% — применяется общая ставка 22%. То же касается товаров, не являющихся медицинскими изделиями (например, биодобавки, косметика), они облагаются по 22%.

Медицинское оборудование как товар не освобождается по пп. 1 п. 2 ст. 149 НК РФ — даже если оно используется для оказания освобождённых услуг. Однако в ряде случаев действует льгота по статье 150 НК РФ при ввозе некоторых видов оборудования, но в общем обороте НДС начисляется.

Раздельный учёт НДС: зачем он нужен и как организовать

Медицинские организации часто оказывают как освобождённые, так и облагаемые услуги (например, стоматологическая клиника может проводить лечение и реализовывать средства гигиены). В этом случае Налоговый кодекс требует вести раздельный учёт доходов, расходов и входного НДС (п. 4 ст. 170 НК РФ). Без него организация не сможет принять к вычету НДС по общехозяйственным расходам (аренда, коммунальные платежи, канцтовары), а налоговые органы могут доначислить налог по всем операциям сразу.

Раздельный учёт строится на следующих принципах:

• доходы разносятся по субсчетам или аналитикам в разрезе «облагаемые» и «необлагаемые» операции;
• прямые затраты относят к тому или иному виду деятельности;
• общехозяйственные расходы распределяются пропорционально доле выручки по каждому виду деятельности в общем объёме выручки (правило «5%» не отменяет обязанности вести раздельный учёт, а лишь даёт право на вычет в полном объёме, если доля необлагаемых операций ниже 5%).

В 1С:Бухгалтерия 8 ред. 3.0 этот механизм реализован через регистр «Раздельный учёт НДС». Настройка включает:

1. Указание в учётной политике, что организация ведёт раздельный учёт.
2. Настройку статей затрат с признаком «Для операций, не облагаемых НДС».
3. Регулярное выполнение регламентной операции «Распределение НДС косвенных расходов» перед закрытием периода.

Мы рекомендуем пересматривать пропорцию распределения ежеквартально и не реже раза в год тестировать расчёт на контрольном примере.

Как настроить учёт медицинских услуг и товаров в 1С

Для актуальных релизов 1С:Бухгалтерия 8 (не ниже 3.0.186.21) поддержана ставка НДС 22%. Для корректного отражения медицинских услуг нужно:

• создать номенклатуру услуг с настройкой «НДС 0%» или «Без НДС» с указанием основания освобождения — пп. 1 п. 2 ст. 149 НК РФ;
• для товаров, облагаемых по ставке 10%, настроить соответствующую ставку в карточке номенклатуры и указать код вида товара для книги продаж;
• при вводе документов отмечать, является ли операция облагаемой или нет, ориентируясь на субсчета учёта НДС (19.01, 19.03 и т.д.).

При работе с раздельным учётом важно не забывать вводить документы «Распределение НДС» ежемесячно, сверять сальдо по счету 19 и контролировать, чтобы все счета-фактуры были зарегистрированы с правильным шифром операции.

Если ваша организация использует несколько конфигураций или имеет доработанную версию 1С, возможно, потребуется дополнительная настройка регистров. Специалисты «Интеграции» помогают с сопровождением 1С — настраивают учётную политику, шаблоны документов и распределение НДС так, чтобы отчётность формировалась без ошибок.

Об этих и других возможностях автоматизации читайте в статье об услугах 1С.

Материал носит справочный характер и не является налоговой или юридической консультацией; для применения к вашей ситуации согласуйте действия с бухгалтером или юристом.